RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590205.2

CACNA1A-210, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 3,340 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-210ENST00000590205 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM223BA6NKX1 122 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.29□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 K7EP34 96 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 M0R381 172 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 GAS8-AS1O95177 125 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 CFHR3Q02985 330 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 MRAP2Q96G30 205 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 SPG11Q96JI7 2443 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 RS1O15537 224 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 ATP5LO75964 103 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 NF1P21359 2839 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 PLXNB1O43157 2135 aa6.28□□□□□ -1.4
CACNA1A-210ENST00000590205 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 HLA-DMBP28068 263 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 RNF183Q96D59 192 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 RAX2Q96IS3 184 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 ATP6V0E1O15342 81 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 GAGE5Q13069 117 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 GAGE6Q13070 117 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 AKAP6Q13023 2319 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C15orf32Q32M92 178 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MTURNQ8N3F0 131 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.27□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM89A2RUT3 159 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 J3QLI3 93 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 CKS2P33552 79 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C20orf78Q9BR46 151 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 DKK2Q9UBU2 259 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 A6NDN8 102 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 SMIM17P0DL12 118 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TWIST1Q15672 202 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MED13LQ71F56 2210 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 Q8TAT8 98 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TOMM6Q96B49 74 aa6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A087WX48 190 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 ERCC8Q13216 396 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A087WW49 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 G3V4G9 280 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGLV1-40P01703 118 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LINC00315P59091 139 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 PRR9Q5T870 116 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 SMR3AQ99954 134 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A1W2PPM0 123 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 GAGE12BA1L429 117 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 CSN3P07498 182 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C20orf173Q96LM9 149 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.25□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 NDUFA4O00483 81 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 PCP2Q8IVA1 136 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 BAALCQ8WXS3 180 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LINC00477Q96M19 166 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 E9PLD3 99 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 SMKR1H3BMG3 65 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 NPFFO15130 113 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LY6G6DO95868 133 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGKCP01834 107 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TRGV3P03979 118 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 ODF3Q96PU9 254 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LINC01548A6NM66 108 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 SAA4P35542 130 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LEPP41159 167 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LAGE3Q14657 143 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 C18orf15Q96N68 181 aa6.24□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 KLLNB2CW77 178 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 S4R3C0 116 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 IGHG2P01859 326 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 PLNP26678 52 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 CEND1Q8N111 149 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 RASL10AQ92737 203 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 LINC01600Q96MT4 127 aa6.23□□□□□ -1.41
CACNA1A-210ENST00000590205 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.23□□□□□ -1.41
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