RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM158Q8WZ71 300 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 INSP01308 110 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SSTP61278 116 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SHISA2Q6UWI4 295 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 AMN1Q8IY45 258 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N1Y9 231 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF185Q96GF1 192 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00310P59036 64 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR31Q5SQ13 230 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 BAGE3Q86Y29 109 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB4AP20338 218 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf56Q8N813 242 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 ATRQ13535 2644 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 NUPR1O60356 82 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 SERF1AO75920 110 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PPBPP02775 128 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A2P29034 98 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 MDFICQ9P1T7 246 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 EVI2AP22794 236 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 C12orf54Q6X4T0 127 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 ORMDL3Q8N138 153 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST1H2BLQ99880 126 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 CBY3A6NI87 242 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R381 172 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCJQ1A5X6 159 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 GTSCR1Q86UQ5 136 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PTH2Q96A98 100 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 D6R8Y8 96 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PDZD11Q5EBL8 140 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 RCHY1Q96PM5 261 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01587Q99440 93 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 XCL2Q9UBD3 114 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRY2O43597 315 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1D1P51857 326 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM18Q96B42 140 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 PRELID3AQ96N28 172 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 AP1S3Q96PC3 154 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC4Q99102 2169 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLL1P15814 213 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 CKS2P33552 79 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB125Q8N687 156 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT8Q8NBV8 401 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-207ENST00000589146 FABP4P15090 132 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 MRAP2Q96G30 205 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF415Q09FC8 603 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NIT1Q86X76 327 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 C11orf72Q8NBR9 251 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00315P59091 139 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 SPXQ9BT56 116 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 SMKR1H3BMG3 65 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NPYP01303 97 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 PRSS47A8MTI9 375 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00614P0C842 121 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R2P5 195 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NCR2O95944 276 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 NRACQ8N912 160 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17DQ8TAD2 202 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 CSTL1Q9H114 145 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-207ENST00000589146 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 VWFP04275 2813 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 GAS8-AS1O95177 125 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF6BO95407 300 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM17P0DL12 118 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 HTN1P15515 57 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF876PQ49A33 203 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 HSBP1O75506 76 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 PRM2P04554 102 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 PMCHP20382 165 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms