RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	COMMD7	Q86VX2	200 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LINC00477	Q96M19	166 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GOSR2	O14653	212 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TCAP	O15273	167 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGLV2-8	P01709	118 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CRISP2	P16562	243 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	S100A7	P31151	101 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IFITM3	Q01628	133 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GAGE5	Q13069	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GAGE6	Q13070	117 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CLLU1	Q5K131	121 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		Q75L30	129 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	BLNK	Q8WV28	456 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	HYLS1	Q96M11	299 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PFDN5	Q99471	154 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC32	Q9BV29	185 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MED9	Q9NWA0	146 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C9orf170	A2RU37	121 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		C9JCJ5	164 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FNDC10	F2Z333	226 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		K7EP13	123 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CCS	O14618	274 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF253	O75346	499 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GPX1	P07203	203 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CAMLG	P49069	296 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PPT1	P50897	306 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLA	Q13239	276 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE2V1	Q13404	147 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MCFD2	Q8NI22	146 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	BAALC	Q8WXS3	180 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SMIM8	Q96KF7	97 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	NIT2	Q9NQR4	276 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		V9GYH0	126 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MUC2	Q02817	5179 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	C7orf66	A4D0T2	115 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	PANO1	I0J062	215 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ORM1	P02763	201 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ASIP	P42127	132 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	CAV2	P51636	162 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	ASAH1	Q13510	395 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	LAGE3	Q14657	143 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	GUK1	Q16774	197 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093		Q5BKY6	102 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX261	Q6UWH6	196 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPRM-206	ENST00000578093	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2

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