RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa18.22■□□□□ 0.51
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C18orf65Q6ZTR6 163 aa18.06■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRAP2Q96G30 205 aa18.06■□□□□ 0.48
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMIM2Q9BVW6 85 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP1-1Q07627 177 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR5A1Q8NGJ0 315 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TM2D2Q9BX73 214 aa18.04■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SAMD5Q5TGI4 173 aa18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEGR1Q7Z3B1 354 aa18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM86BQ8N661 226 aa18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACANP16112 2415 aa18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YAE1D1Q9NRH1 226 aa18.03■□□□□ 0.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP9Q99996 3911 aa18.02■□□□□ 0.48
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