RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 PIFOQ8TCI5 191 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 MSMPQ1L6U9 139 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N7P7 452 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 PIP4P1Q86T03 277 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 TIMM17AQ99595 171 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 TM2D2Q9BX73 214 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB131AP59861 70 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 CRYBA4P53673 196 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 SYNJ2BPP57105 145 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 HERVK_113P63121 156 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 PF4P02776 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00310P59036 64 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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PTPRM-205ENST00000577827 K7ENP7 123 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 SOCS3O14543 225 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 IGLC6P0CF74 106 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 GNRH2O43555 120 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 RNF114Q9Y508 228 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 BAALCQ8WXS3 180 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 A4D1N5 150 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 MSMBP08118 114 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 JPT2Q9H910 190 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf86A6NJI1 115 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01620Q4KN68 170 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 U3KQK5 164 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 B5MCH6 92 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRM-205ENST00000577827 KNCNA6PVL3 124 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N976 141 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 H3BT86 120 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 SS18Q15532 418 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 F6UB75 175 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PRX2 142 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 C2orf91Q6ZV80 131 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM243Q9BU79 118 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRM-205ENST00000577827 UBL5Q9BZL1 73 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01619G3V211 115 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 RNF152Q8N8N0 203 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 DYSFO75923 2080 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 K7EMT4 169 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV2-11P01706 119 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 VWC2LB2RUY7 222 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 TRACP01848 142 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-205ENST00000577827 CRIP1P50238 77 aa7.97□□□□□ -1.13
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