RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 M0R3E3 92 aa9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HOXA5P20719 270 aa9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 C16orf92Q96LL3 132 aa9.71□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HLA-DQA1P01909 254 aa9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 EMP1P54849 157 aa9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TCL1AP56279 114 aa9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 FXYD7P58549 80 aa9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HLA-DRB4P13762 266 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 S100A2P29034 98 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ID1P41134 155 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 RAB4BP61018 213 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SMUG1Q53HV7 270 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 Q6AWC8 147 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 NEU1Q99519 415 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 NRN1Q9NPD7 142 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.69□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SNURFLB1AK76 121 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 PHOX2AO14813 284 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV3-20P01619 116 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 BORCS7Q96B45 105 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 DKK2Q9UBU2 259 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GW15 77 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HIGD1CA8MV81 97 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 NUP35Q8NFH5 326 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM189A5PLL7 270 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF138P52744 262 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 RIGQ13278 110 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SOCS3O14543 225 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 SPINK4O60575 86 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 APCSP02743 223 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HTN3P15516 51 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 HBBP68871 147 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TNP2Q05952 138 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF738Q8NE65 137 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00477Q96M19 166 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 VGLL1Q99990 258 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS3-202ENST00000572078 F6UB75 175 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 CRISP2P16562 243 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 RNF182Q8N6D2 247 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 C8orf49Q96NF6 230 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 SH2D1AO60880 128 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 PRM2P04554 102 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 HERC1Q15751 4861 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GUT8 65 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM6P0DI80 62 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 Q0VG73 95 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 ERCC8Q13216 396 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 BAGE3Q86Y29 109 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM18Q96B42 140 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GXF2 115 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 PRAC2D3DTV9 90 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 CAMPP49913 170 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 CRIP1P50238 77 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 Q8TAT8 98 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 C20orf173Q96LM9 149 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms