RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.96	□□□□□ -1.61
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IGHG4	P01861	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CT83	Q5H943	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CCL24	O00175	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FCGR3B	O75015	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		Q6AWC8	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PROP1	O75360	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFA3	O95167	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PYY	P10082	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PSMB8	P28062	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GNG5	P63218	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CEND1	Q8N111	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NPB	Q8NG41	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		J3KRW8	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		P01737	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RITA1	Q96K30	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NBR2	O15453	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CNTFR	P26992	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FXYD7	P58549	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ERVK-16	P61578	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		G3V318	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ARL3	P36405	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ID1	P41134	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	MYOD1	P15172	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	NDP	Q00604	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	RNF5	Q99942	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WX48	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FGD4-215	ENST00000551984		A0A1B0GUT8	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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