RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 H0YIZ8 118 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 OR2T35Q8NGX2 323 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 SMIM3Q9BZL3 60 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-227ENST00000551441 KCNIP2Q9NS61 270 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 C9orf85Q96MD7 179 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 JPT2Q9H910 190 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 RNF222A6NCQ9 220 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 TAS2R45P59539 299 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 TOR2AQ5JU69 321 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 Q8N976 141 aa10.5□□□□□ -0.73
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CS-227ENST00000551441 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 PARLQ9H300 379 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.48□□□□□ -0.73
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CS-227ENST00000551441 SCGB1C1Q8TD33 95 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 UBE2WQ96B02 151 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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CS-227ENST00000551441 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 PRNTQ86SH4 94 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 RMI2Q96E14 147 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 PSG8Q9UQ74 426 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 COX11Q9Y6N1 276 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PPV4 95 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 IGLV2-11P01706 119 aa10.45□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 NIT1Q86X76 327 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 WFDC1Q9HC57 220 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 HSPB11Q9Y547 144 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 LINC00479Q96M42 142 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 TCRAP04437 139 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 ARL14EPLP0DKL9 152 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 SMUG1Q53HV7 270 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.43□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 LRP2P98164 4655 aa10.42□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 A0A087WWC5 75 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 A8MWV9 139 aa10.42□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 SH3BGRL3Q9H299 93 aa10.42□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 A0A087WX48 190 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 MT1HL1P0DM35 61 aa10.41□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 A0A087WWL8 130 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 TRAV34A0A0B4J273 112 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 H3BVH4 76 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
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CS-227ENST00000551441 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-227ENST00000551441 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 TMEM262E9PQX1 116 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 PANO1I0J062 215 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 MPC2O95563 127 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 ASIPP42127 132 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
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CS-227ENST00000551441 HLA-DQA1P01909 254 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 GCHFRP30047 84 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 ENHOQ6UWT2 76 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.38□□□□□ -0.75
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CS-227ENST00000551441 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 USP17L23D6RBM5 183 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 M0R036 132 aa10.37□□□□□ -0.75
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CS-227ENST00000551441 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-227ENST00000551441 ENKURQ8TC29 256 aa10.37□□□□□ -0.75
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