RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.36□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 VAX2Q9UIW0 290 aa6.36□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 hDV102S1A0JD36 115 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 A8MWV9 139 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 H7C1H1 209 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 BCAP31P51572 246 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 FXYD5Q96DB9 178 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 TREM1Q9NP99 234 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.35□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 C9orf170A2RU37 121 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 FAM231BA6NCW3 169 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 CST7O76096 145 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 NMES1Q9C002 83 aa6.34□□□□□ -1.39
KDM5A-211ENST00000544777 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 FGF7P21781 194 aa6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 AP3S2P59780 193 aa6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 MPV17L2Q567V2 206 aa6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 HYLS1Q96M11 299 aa6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 OR7C2O60412 319 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TCRBP04435 133 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 S100A11P31949 105 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CTF1Q16619 201 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 MAJINQ3KP22 176 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TVP23CQ96ET8 276 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.32□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 A0A087WWL8 130 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 STPG4Q8N801 248 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 JPT2Q9H910 190 aa6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 RHODO00212 210 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 SLPIP03973 132 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 S100A10P60903 97 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PKIAP61925 76 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 HBG1P69891 147 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 HBG2P69892 147 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 COX6A2Q02221 97 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PRR4Q16378 134 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.3□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CCSO14618 274 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 IFNA7P01567 189 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 SULT1A1P50225 295 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 ATP6V1FQ16864 119 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 Q6ZRP5 223 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 OTORQ9NRC9 128 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PRR34Q9NV39 138 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.29□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2D3P61077 147 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 UBE2D2P62837 147 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 STX12Q86Y82 276 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.28□□□□□ -1.4
KDM5A-211ENST00000544777 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.27□□□□□ -1.41
KDM5A-211ENST00000544777 ATP6V1G2O95670 118 aa6.27□□□□□ -1.41
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