RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 V9GYV3 84 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRB-204ENST00000538708 MTURNQ8N3F0 131 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZSV7 163 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRB-204ENST00000538708 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRB-204ENST00000538708 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-204ENST00000538708 E7EUB6 86 aa7.21□□□□□ -1.25
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PTPRB-204ENST00000538708 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-204ENST00000538708 IGF1P05019 195 aa7.21□□□□□ -1.26
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