RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 SPANXCQ9NY87 97 aa8.25□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 ODF3BA8MYP8 253 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 H3BMM0 161 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 H3BT86 120 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 M0R2P5 195 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 MGPP08493 103 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 COX6CP09669 75 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 PRTN3P24158 256 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 EBI3Q14213 229 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 Q8N1Y9 231 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 RNF182Q8N6D2 247 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 UBE2WQ96B02 151 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 CADP27708 2225 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 CEP250Q9BV73 2442 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 IGIPA6NJ69 53 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-69P01742 117 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 Q8N6K4 173 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.24□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 NXPH4O95158 308 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-23P01764 117 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 Q1RN00 199 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 ZNF876PQ49A33 203 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C16orf92Q96LL3 132 aa8.23□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 A4D1N5 150 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 E7EQL1 145 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 LGALS9O00182 355 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 CRYGDP07320 174 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C15orf32Q32M92 178 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 MDFICQ9P1T7 246 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 U3KQE9 123 aa8.22□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 RNF223E7ERA6 249 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 ACYP1P07311 99 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 NDPQ00604 133 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 RHOHQ15669 191 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 IMUPQ9GZP8 106 aa8.21□□□□□ -1.09
LMO3-215ENST00000537304 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 CD3EP07766 207 aa8.21□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 PLCE1Q9P212 2302 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 A0A0G2JNJ9 132 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 CCDC179H3BU77 68 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 HERV-K104P63124 156 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 LY6DQ14210 128 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZS46 218 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 GPHB5Q86YW7 130 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 AMELXQ99217 191 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 Q9UFV3 132 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TMEM223A0PJW6 202 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TGFAP01135 160 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 FOXC1Q12948 553 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 C2orf82Q6UX34 121 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TMEM101Q96IK0 257 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 ODF3Q96PU9 254 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TSHBP01222 138 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 ATP5G1P05496 136 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 LINC01548A6NM66 108 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.18□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
LMO3-215ENST00000537304 SVILO95425 2214 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms