RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HERC2O95714 4834 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNAH2Q9P225 4427 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RS1O15537 224 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TIRAPP58753 221 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UBE2G2P60604 165 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RGS21Q2M5E4 152 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PTH2Q96A98 100 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C9orf85Q96MD7 179 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.94□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PEX7O00628 323 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PSCAO43653 123 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ASIPP42127 132 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF726P1Q15940 193 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q8N1X5 172 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00479Q96M42 142 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.93□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A087WTM6 91 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM74A7A6NL05 159 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A8MWV9 139 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 B4DEV8 164 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARPC5O15511 151 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UBE2G1P62253 170 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q86TA4 180 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 STOML3Q8TAV4 291 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FMC1Q96HJ9 113 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LELP1Q5T871 98 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SYT8Q8NBV8 401 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PARLQ9H300 379 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IL36BQ9NZH7 164 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H3BVH4 76 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 M0R036 132 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RHODO00212 210 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-30P01768 117 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-33P01772 117 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LCE1DQ5T752 114 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CST9LP1Q5W188 147 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q9HAA7 133 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 G3V3Q6 166 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SH2D1AO60880 128 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FHITP49789 147 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZNF345Q14585 488 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNLZQ5SXM8 178 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR11H4Q8NGC9 324 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 A0A087WWC5 75 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE12JA6NER3 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 EPM2AB3EWF7 344 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UMAD1C9J7I0 102 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SEC11BP0C7V7 166 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GCSHP23434 173 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AKR1C3P42330 323 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE1Q13065 139 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE4Q13068 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE5Q13069 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LAGE3Q14657 143 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE13Q4V321 117 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-210ENST00000533039 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms