RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532483.5

RBM25-211, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 5

Gene RBM25, Length 1,052 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-211	ENST00000532483	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		S4R3C0	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ABCA4	P78363	2273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SLURP1	P55000	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		G3V4G9	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		H3BUT2	72 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		H3BVH4	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PF4V1	P10720	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	GCSH	P23434	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ATP5J2	P56134	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CFHR3	Q02985	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PMVK	Q15126	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		Q6ZVH6	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		H3BUX3	64 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PSMB8	P28062	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TCTA	P57738	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CDSN	Q15517	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RASL10A	Q92737	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		M0QXV9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		Q5PR19	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RNF183	Q96D59	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		A0A0J9YX75	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		A0A1W2PPR1	153 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		A8MWV9	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	IGLL5	B9A064	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483		I3L3M4	83 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	RHOD	O00212	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	CIDEA	O60543	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM25-211	ENST00000532483	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms