RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		F6UZH7	168 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		K7EQD1	137 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	GNRH2	O43555	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	GCG	P01275	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TYMS	P04818	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PPT1	P50897	306 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TIRAP	P58753	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	GNG5	P63218	68 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		Q5BKY6	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PTH2	Q96A98	100 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	EVI2A	P22794	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	LINC00315	P59091	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	HERC2	O95714	4834 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		A0A087WWL8	130 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ARPC5	O15511	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	IFNA7	P01567	189 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF345	Q14585	488 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	RHOH	Q15669	191 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474		A8MWV9	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	PEX7	O00628	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	RS1	O15537	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ASIP	P42127	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	FHIT	P49789	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	MUC4	Q99102	2169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474		A0A0D9SG52	128 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474		G3V3Q6	166 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	RHOD	O00212	210 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	CRYGD	P07320	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2G2	P60604	165 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2G1	P62253	170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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