RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531659.1

RPS6KA4-206, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 2

Gene RPS6KA4, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	MLST8	Q9BVC4	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	PARL	Q9H300	379 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ZNF415	Q09FC8	603 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	OR5I1	Q13606	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659		Q6ZQT7	251 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659		Q8N1X5	172 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPS6KA4-206	ENST00000531659		H3BNG1	76 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SH2D1A	O60880	128 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	HOXA5	P20719	270 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ORM1	P02763	201 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ESRG	Q1W209	222 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ZNF727	A8MUV8	499 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659		B4DEV8	164 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TYMS	P04818	313 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TCL1A	P56279	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659		A0A0J9YY99	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GAGE7	O76087	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	CRIP1	P50238	77 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SPX	Q9BT56	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	KRTAP10-2	P60368	255 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GNRH2	O43555	120 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ASIP	P42127	132 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RPS6KA4-206	ENST00000531659	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		M0R036	132 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	UQCC3	Q6UW78	93 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	OCC1	Q8TAD7	63 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	XKRY2	A2RUG3	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		C9JQL5	133 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		P01737	135 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	CXCL1	P09341	107 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		Q6ZTI0	123 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		A0A096LPF7	62 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		M0R2P5	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SPINK4	O60575	86 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		K7EN84	100 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	LINC01551	Q86U37	167 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	C9orf85	Q96MD7	179 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPS6KA4-206	ENST00000531659	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659		H3BVH4	76 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	ERVFC1-1	P60608	527 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	LINC00315	P59091	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPS6KA4-206	ENST00000531659	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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