RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A4P12235 298 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OGNP20774 298 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCALDP61601 193 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPC2P61916 151 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM97Q5BJF2 176 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8J2Q8NGG1 315 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX7B2Q8TF08 81 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 V9GYV3 84 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAMA3Q16787 3333 aa-1.95□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAH11Q96DT5 4516 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 M0R2P5 195 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOC1P02654 83 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCDP81605 110 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C20orf197Q8N268 126 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10X1Q8NGY0 326 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCEEQ96PE7 176 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIGMAR1Q99720 223 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMIM7Q9BQ49 75 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-1.96□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLXNA2O75051 1894 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM114B3SHH9 223 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MT1AP04731 61 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADCYAP1P18509 176 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTMSP20962 102 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAXP61244 160 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BLCAPP62952 87 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR5H6Q8NGV6 325 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRTM1Q9HBL6 345 aa-1.97□□□□□ -2.72
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX6B1P14854 86 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR8B8Q15620 311 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB135Q30KP9 77 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4S1Q8NGB4 309 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFI27L1Q96BM0 104 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SDF2Q99470 211 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCN3BQ9NY72 215 aa-1.98□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLC1Q96QB1 1528 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPINK4O60575 86 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFP01375 233 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNA6P05013 189 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNG5P63218 68 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTL8BQ17RB0 113 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRELID3AQ96N28 172 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFDC6Q9BQY6 131 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PBDC1Q9BVG4 233 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTL8AQ9BWD3 113 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLXNB2O15031 1838 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3C2AO00443 1686 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TANC2Q9HCD6 1990 aa-1.99□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBR2Q8IWV8 1755 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSC2P49815 1807 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIIAD1A6NNX1 92 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVS71-1P61550 626 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BORCS8Q96FH0 119 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRNDQ9UKY0 176 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-2□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPRMP28827 1452 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR97A6NE52 1622 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRP6O75581 1613 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NDUFC2O95298 119 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNA21P01568 189 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FABP2P12104 132 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A6P12236 298 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q5VV11 94 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MORN4Q8NDC4 146 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OTOSQ8NHW6 89 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NEK7Q8TDX7 302 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC42Q96M95 316 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00472Q9H8W2 130 aa-2.01□□□□□ -2.73
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-2.01□□□□□ -2.73
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