RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01548	A6NM66	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BMG7	143 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		H3BVH4	76 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V0E1	O15342	81 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TSHB	P01222	138 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGF1	P05019	195 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CD7	P09564	240 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2E1	P51965	193 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2D3	P61077	147 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2D2	P62837	147 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	METTL26	Q96S19	204 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA4	P78363	2273 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WW49	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PRX2	142 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		G3V318	75 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		J3QR89	54 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	OVOL1	O14753	267 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	BRI3	O95415	125 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYGD	P07320	174 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	GYPE	P15421	78 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	INSL3	P51460	131 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CDSN	Q15517	529 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	AMELX	Q99217	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	IGIP	A6NJ69	53 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf86	A6NJI1	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM223B	A6NKX1	122 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		M0QXV9	152 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPAN13	O95857	204 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R17	O96001	155 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PF4V1	P10720	104 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ASIP	P42127	132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5G2	Q06055	141 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	FHL3	Q13643	280 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNA1B	Q00975	2339 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0J9YY99	117 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01549	A6NIU2	74 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746		K7ENP7	123 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NPFF	O15130	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SPRY2	O43597	315 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	SAA4	P35542	130 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	LMO4	P61968	165 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	TCF15	Q12870	199 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXI1	Q12951	378 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ATXN3-212	ENST00000515746	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81

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