RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515143.5

SPOCK3-223, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, human

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCK3-223	ENST00000515143	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A087WTM6	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	GCG	P01275	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	EVI2A	P22794	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CRIP1	P50238	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	GNG5	P63218	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		A8MWV9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	XG	P55808	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RHOH	Q15669	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LELP1	Q5T871	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		F6UZH7	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	C1QB	P02746	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CXCL1	P09341	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PPT1	P50897	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF345	Q14585	488 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LAGE3	Q14657	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A087WWC5	75 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PEX7	O00628	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LTA	P01374	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	CRYGD	P07320	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q6ZSN1	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	PARL	Q9H300	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RHOD	O00212	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q86TA4	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A0D9SG52	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143		B4DEV8	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	IFNA7	P01567	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ASIP	P42127	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAT1	Q14517	4588 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	ARPC5	O15511	151 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPOCK3-223	ENST00000515143	SH2D1A	O60880	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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