RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		H3BTX0	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		M0R3E3	92 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CST7	O76096	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	GPX1	P07203	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IL7	P13232	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	BAX	Q07812	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ORM1	P02763	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	BCAP31	P51572	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CRYBA4	P53673	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CD300C	Q08708	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IL15RA	Q13261	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		A0A087WTM6	91 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		C9JCJ5	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CCS	O14618	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LYRM1	O43325	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IFNA5	P01569	189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TCRB	P04435	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	FGF7	P21781	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SRI	P30626	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF138	P52744	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF266	Q14584	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR9	Q5T870	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6AWC8	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	FRZB	Q92765	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PLA2G10	O15496	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PYY	P10082	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	EVI2A	P22794	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CSN1S1	P47710	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	S100A10	P60903	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	ERCC8	Q13216	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552		Q5VSD8	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	JPT2	Q9H910	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QB	P02746	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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