RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 RYR3Q15413 4870 aa10.25□□□□□ -0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 P01737 135 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF212Q495C1 297 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 PAX4O43316 350 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFP82Q8N141 532 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP2-208ENST00000504294 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF727A8MUV8 499 aa10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 F2Z2F3 143 aa10.21□□□□□ -0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
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SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3-53P01767 116 aa10.2□□□□□ -0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.2□□□□□ -0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.19□□□□□ -0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 CLLU1Q5K131 121 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.19□□□□□ -0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 ERVFC1-1P60608 527 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-208ENST00000504294 CT83Q5H943 113 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-208ENST00000504294 TPPP3Q9BW30 176 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 OSTCQ9NRP0 149 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A096LPF7 62 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLC6P0CF74 106 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF575Q86XF7 245 aa10.13□□□□□ -0.79
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SH3BP2-208ENST00000504294 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.12□□□□□ -0.79
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