RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	PROP1	O75360	226 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBE2E1	P51965	193 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R1W7	72 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLXNB1	O43157	2135 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCOLCE	Q15113	449 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TECTA	O75443	2155 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV2-11	P01706	119 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf197	Q8N268	126 aa		6.34	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP17L23	D6RBM5	183 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LST1	O00453	97 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	GHRH	P01286	108 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRIP1	P50238	77 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERCC8	Q13216	396 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	EBI3	Q14213	229 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		6.33	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMD	P11532	3685 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEP250	Q9BV73	2442 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYGD	P07320	174 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0G2JNJ9	132 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZS46	218 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A45	Q8N413	288 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAND5	Q8N907	189 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q9UFV3	132 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPEG	Q15772	3267 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV3	P03979	118 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMS2CL	Q68D20	193 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	C9orf85	Q96MD7	179 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R1B8	84 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK14	Q6IE38	97 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD28	P10747	220 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		6.31	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFHR4	Q92496	578 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		S4R3C0	116 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRY2	O43597	315 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBL5	Q9BZL1	73 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMA1	P25391	3075 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	WISP2	O76076	250 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZT83	130 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM17A	Q99595	171 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549		I3L3M4	83 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAX8	Q06710	450 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.3	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01546	A6NGU7	62 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHG3	P01860	377 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRP	P02741	224 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM201A	Q5SY85	155 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	EDN2	P20800	178 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMB8	P28062	276 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CRNKL1-205	ENST00000496549	RETN	Q9HD89	108 aa		6.29	□□□□□ -1.4

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