RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF638-222ENST00000491843 OR2H2O95918 312 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 HBDP02042 147 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 ADCYAP1P18509 176 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 STX12Q86Y82 276 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 MYH1P12882 1939 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 A2MP01023 1474 aa-0.68□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 C9JAW5 83 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 F2Z2F3 143 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 IFNA21P01568 189 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 AKAP6Q13023 2319 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 LPAP08519 4548 aa-0.69□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 COL6A3P12111 3177 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 A0A1W2PRE2 83 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 CKS2P33552 79 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 TMEM141Q96I45 108 aa-0.7□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 E7EQ34 232 aa-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 SPRR2DP22532 72 aa-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 UQCRQO14949 82 aa-0.72□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 APOC1P02654 83 aa-0.72□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.72□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 GID8Q9NWU2 228 aa-0.72□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.72□□□□□ -2.52
ZNF638-222ENST00000491843 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.72□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TRIQKQ629K1 86 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 HERC2O95714 4834 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 FAT1Q14517 4588 aa-0.73□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 E5RI56 91 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 NMBP08949 121 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.74□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 PLXNA2O75051 1894 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 LAMA5O15230 3695 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.75□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 M0QZK8 103 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 MT4P47944 62 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 PLGLB1Q02325 96 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 PCBD2Q9H0N5 130 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.76□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 VWFP04275 2813 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 IFITM1P13164 125 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 AKR1D1P51857 326 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 PCBD1P61457 104 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TGP01266 2768 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 SPTBN2O15020 2390 aa-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 LAMB1P07942 1786 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 A0A087WTM6 91 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 OR2T2Q6IF00 324 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CCDC115Q96NT0 180 aa-0.78□□□□□ -2.53
ZNF638-222ENST00000491843 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms