RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CD7	P09564	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CRYBA4	P53673	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TCTA	P57738	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RBX1	P62877	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LY6D	Q14210	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LY6E	Q16553	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RHOD	O00212	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PRY	O14603	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	COX6B1	P14854	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	FXYD7	P58549	80 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF56	Q15929	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RASL10A	Q92737	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		A8MWV9	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		G3V4G9	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		I3L3M4	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PSMB8	P28062	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		A0A0J9YX75	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1B0GWB2	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1W2PPR1	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	IGLL5	B9A064	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228		K7EQG2	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	PTH2	Q96A98	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	GNRH2	O43555	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	FXYD2	P54710	66 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	PRR9	Q5T870	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228		Q6ZVH6	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRP2-204	ENST00000491228	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms