RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CACNG7	P62955	275 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR9	Q5T870	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	CSN3	P07498	182 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	LEP	P41159	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8N976	141 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	HSBP1	O75506	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00614	P0C842	121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	NTF3	P20783	257 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	AMT	P48728	403 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PKIA	P61925	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TWIST1	Q15672	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	C7orf71	A4D174	169 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247		D6R8Y8	96 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247		F6UB75	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R381	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOD	O00212	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	SRD5A1	P18405	259 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPO	P30536	169 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	ASIP	P42127	132 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PTH2	Q96A98	100 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	PRELID3A	Q96N28	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A096LNJ9	63 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247		M0R2Z0	102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL24	O00175	119 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	TCF21	O43680	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6G6D	O95868	133 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CD28	P10747	220 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	CDKN1B	P46527	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB1	P60022	68 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZQT7	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	NRAC	Q8N912	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG4A-208	ENST00000489247	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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