RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	CIDEA	O60543	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1W2PRE2	83 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TAAR5	O14804	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GNRH2	O43555	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GCG	P01275	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TIRAP	P58753	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	LECT2	O14960	151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RHOH	Q15669	191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PTH2	Q96A98	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RMI2	Q96E14	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	FAT1	Q14517	4588 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IFNA7	P01567	189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100		Q5BKY6	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	PEX7	O00628	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ASIP	P42127	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		Q86TA4	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100		A8MWV9	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ARPC5	O15511	151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	UBE2G2	P60604	165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	UBE2G1	P62253	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LAGE3	Q14657	143 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	LELP1	Q5T871	98 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM107B-223	ENST00000489100	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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