RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487271.5

TRAF3IP3-215, Transcript of TRAF3 interacting protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene TRAF3IP3, Length 499 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 F2Z2F3 143 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CXCL1P09341 107 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CT83Q5H943 113 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 ZFP82Q8N141 532 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TSKUQ8WUA8 353 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SPINK4O60575 86 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 MED14OSP0DP75 135 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 HTN3P15516 51 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CACNG7P62955 275 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TWIST1Q15672 202 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 DNLZQ5SXM8 178 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 Q6ZTI0 123 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CELA1Q9UNI1 258 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 V9GYV3 84 aa7.25□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 HIGD1CA8MV81 97 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 OR5AL1P0C617 328 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SMIM17P0DL12 118 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 S100PP25815 95 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RHEBQ15382 184 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 IL17DQ8TAD2 202 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 C9orf85Q96MD7 179 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 FAM231BA6NCW3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SNAI2O43623 268 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 IGHV3-53P01767 116 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 IGLC6P0CF74 106 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 GTSF1Q8WW33 167 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RASL10AQ92737 203 aa7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 A8MWV9 139 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 ATP5G1P05496 136 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NTF3P20783 257 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RIGQ13278 110 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 C12orf74Q32Q52 190 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NUP35Q8NFH5 326 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 FBN3Q75N90 2809 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAF3IP3-215ENST00000487271 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 A0A1B0GUT8 65 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 F5H768 121 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TRGC1P0CF51 173 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 WDR73Q6P4I2 378 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 Q6ZTC4 211 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 ZNF575Q86XF7 245 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PTH2Q96A98 100 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 AP1S3Q96PC3 154 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.21□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 A0A087WWC5 75 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 A0A087WWL8 130 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 F5H697 171 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CTRLP40313 264 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CAMPP49913 170 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 IMMP2LQ96T52 175 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.2□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 RS1O15537 224 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CIDEAO60543 219 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 S100A8P05109 93 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 MGPP08493 103 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRAF3IP3-215ENST00000487271 ZNF479Q96JC4 524 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms