RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 M0R2Z0 102 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PRM2P04554 102 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SFTA3P0C7M3 94 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 AKR1C3P42330 323 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2G1P62253 170 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PEA15Q15121 130 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PRR9Q5T870 116 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TVP23CQ96ET8 276 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TUBA4BQ9H853 241 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PSG8Q9UQ74 426 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 PRELID1Q9Y255 219 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 DNHD1Q96M86 4753 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-211ENST00000484135 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF727A8MUV8 499 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 K7EIL1 84 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 PDE6DO43924 150 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DRB4P13762 266 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF138P52744 262 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 BTN1A1Q13410 526 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 OR5I1Q13606 314 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 CENPWQ5EE01 88 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ERASQ7Z444 233 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 BAGE2Q86Y30 109 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 MRAPQ8TCY5 172 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 PARLQ9H300 379 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF492Q9P255 531 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 XCL2Q9UBD3 114 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM218A2RU14 115 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 F8W036 122 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM250H0YL14 139 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 K7EQM0 130 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 HTN1P15515 57 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ADCYAP1P18509 176 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 GNG4P50150 75 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 CRIP1P50238 77 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 MUC21Q5SSG8 566 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 AMTNQ6UX39 209 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 Q86TA4 180 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf52Q96A22 123 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00477Q96M19 166 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 NOTCH1P46531 2555 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 K7EN84 100 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 M0R036 132 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 AZU1P20160 251 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-211ENST00000484135 TAS2R60P59551 318 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-211ENST00000484135 DEFA6Q01524 100 aa3.38□□□□□ -1.87
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