RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 CRISP2P16562 243 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 CTRLP40313 264 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZSN1 163 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 APRG1Q8IVJ8 170 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.53□□□□□ -1.68
SKAP2-204ENST00000481204 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 USP17L23D6RBM5 183 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 H3BVH4 76 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SAP30O75446 220 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SERF1AO75920 110 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 AMBPP02760 352 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 MT-ND6P03923 174 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 FABP4P15090 132 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PAFAH1B2P68402 229 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RIGQ13278 110 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 COX19Q49B96 90 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RASL11AQ6T310 242 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 AMTNQ6UX39 209 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RCHY1Q96PM5 261 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 MUC4Q99102 2169 aa4.52□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 C7orf71A4D174 169 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 KLLNB2CW77 178 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SMKR1H3BMG3 65 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 GAS8-AS1O95177 125 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PRM2P04554 102 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 NTF3P20783 257 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 LEPP41159 167 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TWIST1Q15672 202 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 Q6AWC8 147 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 BAGE3Q86Y29 109 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 AMN1Q8IY45 258 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 BORCS7Q96B45 105 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.51□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 JMJD1CQ15652 2540 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 OR4C46A6NHA9 309 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 H3BMM0 161 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 NCR2O95944 276 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 S100A2P29034 98 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 Q0VG73 95 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 GATD1Q8NB37 220 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 VWFP04275 2813 aa4.5□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 A8MTW9 85 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 SNAI2O43623 268 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 IGLV1-51P01701 117 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 CD7P09564 240 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 HLA-DRB4P13762 266 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PMCHP20382 165 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 EVI2AP22794 236 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ASIPP42127 132 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PYY3Q5JQD4 70 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 Q6ZWC4 215 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 RNF185Q96GF1 192 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ODF3Q96PU9 254 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 MDFICQ9P1T7 246 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 ATRQ13535 2644 aa4.49□□□□□ -1.69
SKAP2-204ENST00000481204 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms