RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ODF3BA8MYP8 253 aa10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 CD7P09564 240 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZS46 218 aa10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 TEN1Q86WV5 123 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 SBSPONQ8IVN8 264 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC140Q96MF4 163 aa10.29□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.24□□□□□ -0.77
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.21□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 M0QXV9 152 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 TRBV12-3P01733 135 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 HERVK_113P61574 105 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 EBI3Q14213 229 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM219Q86XT9 240 aa10.2□□□□□ -0.78
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