RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.01□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 Q8N976 141 aa7.01□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 RNF183Q96D59 192 aa7.01□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.01□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.01□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 H7C1H1 209 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 C7orf71A4D174 169 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 GAGE10A6NGK3 116 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 IGLL5B9A064 214 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 RIGQ13278 110 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 WFDC9Q8NEX5 89 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TAX1BP3O14907 124 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 UBE2L6O14933 153 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ERCC8Q13216 396 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 FAM162BQ5T6X4 162 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 FMC1Q96HJ9 113 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 KLK9Q9UKQ9 250 aa7□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 F2Z2F3 143 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 K7EQG2 157 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ESDP10768 282 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TWIST1Q15672 202 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 RNF152Q8N8N0 203 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 DPH3Q96FX2 82 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.99□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ATP5G1P05496 136 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 P0C879 139 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ATP5G3P48201 142 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 CAMPP49913 170 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 FCER1GP30273 86 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 VSIRQ9H7M9 311 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 NAT8Q9UHE5 227 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PSCAO43653 123 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 SPINK4O60575 86 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TCRAP04437 139 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 CCL18P55774 89 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WX48 190 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TYMSP04818 313 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 MPV17L2Q567V2 206 aa6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 CR1P17927 2039 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM250H0YL14 139 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 HLA-DRB4P13762 266 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 HLA-DMBP28068 263 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 NACAE9PAV3 2078 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 VWC2Q2TAL6 325 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 BAGE3Q86Y29 109 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 TENM4Q6N022 2769 aa6.97□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PRR20EP86478 221 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PRR20CP86479 221 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PRR20DP86480 221 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PRR20BP86481 221 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PRR20AP86496 221 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 CENPWQ5EE01 88 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 RAB37Q96AX2 223 aa6.96□□□□□ -1.29
DDX39B-215ENST00000462256 PMCHP20382 165 aa6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF876PQ49A33 203 aa6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 H0Y8G0 127 aa6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 MIFP14174 115 aa6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 C16orf74Q96GX8 76 aa6.96□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 H3BVH4 76 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 PAX4O43316 350 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 CRISP2P16562 243 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 C17orf77Q96MU5 243 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0J9YX75 114 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF253O75346 499 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 SRIP30626 198 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.95□□□□□ -1.3
DDX39B-215ENST00000462256 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms