RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GVY2 172 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 XKRY2A2RUG3 117 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 IFNA7P01567 189 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 SMUG1Q53HV7 270 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 Q86TA4 180 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 RASL10AQ92737 203 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf85Q96MD7 179 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q9UF83 564 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 UMAD1C9J7I0 102 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 C9JCJ5 164 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 SH2D1AO60880 128 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZSN1 163 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 K7EQD1 137 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EQM0 130 aa4.8□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2G1P62253 170 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP69Q49AA0 526 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 BAGE2Q86Y30 109 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.78□□□□□ -1.64
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