RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 SPXQ9BT56 116 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 OSTCQ9NRP0 149 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 IL36BQ9NZH7 164 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 MUC4Q99102 2169 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 F8W036 122 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 MED14OSP0DP75 135 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 GZMBP10144 247 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 C12orf74Q32Q52 190 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 SFRP2Q96HF1 295 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 SEC11CQ9BY50 192 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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GARNL3-211ENST00000460176 M0R2P5 195 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 IGLC6P0CF74 106 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 CT83Q5H943 113 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 PTH2Q96A98 100 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 V9GYV3 84 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 TGP01266 2768 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE12BA1L429 117 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 XKRY2A2RUG3 117 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 SNAI2O43623 268 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE7O76087 117 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 OR5AL1P0C617 328 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE12FP0CL80 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 GAGE12IP0CL82 117 aa7.26□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 DAD1P61803 113 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZTC4 211 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 GTSF1Q8WW33 167 aa7.26□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 A8MWL6 223 aa7.25□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 ZNF876PQ49A33 203 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 C18orf15Q96N68 181 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 CDIP1Q9H305 208 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 NACAE9PAV3 2078 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.24□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PPQ1 181 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 NXPH4O95158 308 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 CTRLP40313 264 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 RNF212Q495C1 297 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 TSKUQ8WUA8 353 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 F2Z2F3 143 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 M0R381 172 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 ZFP82Q8N141 532 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 MUC7Q8TAX7 377 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 TPPP3Q9BW30 176 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.23□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.22□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 FAM231BA6NCW3 169 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 PPP1R2P9O14990 202 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 RS1O15537 224 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-53P01767 116 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 MT-ND4LP03901 98 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 ATP5G1P05496 136 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 HOXA5P20719 270 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.22□□□□□ -1.25
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GARNL3-211ENST00000460176 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF479Q96JC4 524 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 CNFNQ9BYD5 112 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 JPT2Q9H910 190 aa7.22□□□□□ -1.25
GARNL3-211ENST00000460176 HIGD1CA8MV81 97 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-211ENST00000460176 A8MWV9 139 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-211ENST00000460176 APOC3P02656 99 aa7.21□□□□□ -1.26
GARNL3-211ENST00000460176 HTN3P15516 51 aa7.21□□□□□ -1.26
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