RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 U3KQK5 164 aa6.83□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSBP1O75506 76 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PPBPP02775 128 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDTP30046 118 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C14orf144Q96I85 54 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RCHY1Q96PM5 261 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.82□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NTF3P20783 257 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMTP48728 403 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 STHQ8IWL8 128 aa6.81□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 KNCNA6PVL3 124 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00614P0C842 121 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASIPP42127 132 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIR3DS1Q14943 382 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZWC4 215 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NIT1Q86X76 327 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 ORMDL3Q8N138 153 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTH2Q96A98 100 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAGKQ9UJ70 344 aa6.8□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TWIST1Q15672 202 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPPP3Q9BW30 176 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0R2Z0 102 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 GNRH2O43555 120 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NXPH4O95158 308 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCGB1D1O95968 90 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZQT7 251 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB125Q8N687 156 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf56Q8N813 242 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 MDFIQ99750 246 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.79□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV3-20P01619 116 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf85Q96MD7 179 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.78□□□□□ -1.32
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GV90 55 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01546A6NGU7 62 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS47A8MTI9 375 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3KRW8 73 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 INSP01308 110 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD7P09564 240 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMCHL1Q16048 86 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUC21Q5SSG8 566 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 AMN1Q8IY45 258 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N1Y9 231 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRELID3AQ96N28 172 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 D6R8Y8 96 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 CKS2P33552 79 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF185Q96GF1 192 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPXQ9BT56 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 JMJD1CQ15652 2540 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BVH4 76 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 TCAPO15273 167 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf79P0CE67 100 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTDAPP60985 99 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR31Q5SQ13 230 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 FA2HQ7L5A8 372 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYT8Q8NBV8 401 aa6.75□□□□□ -1.33
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.75□□□□□ -1.33
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