RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 C7orf71A4D174 169 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 KLLNB2CW77 178 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TSPOP30536 169 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 LEPP41159 167 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ERVFC1-1P60608 527 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 Q6AWC8 147 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 C16orf74Q96GX8 76 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 BTF3L4Q96K17 158 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SGK494Q96LW2 274 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 YPEL4Q96NS1 127 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 V9GYV3 84 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 A8MWL6 223 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 H7BYZ3 331 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 CXCL1P09341 107 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 OR5I1Q13606 314 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DNLZQ5SXM8 178 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF575Q86XF7 245 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 HOXA5P20719 270 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 Q6ZTI0 123 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TSKUQ8WUA8 353 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 C8orf49Q96NF6 230 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 IL36BQ9NZH7 164 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12BA1L429 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 XKRY2A2RUG3 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 COLCA2A8K830 154 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 LYRM9A8MSI8 78 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 M0R2N4 97 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE7O76087 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 P01737 135 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GPX1P07203 203 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12FP0CL80 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12GP0CL81 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE12IP0CL82 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 ELOBQ15370 118 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TDRG1Q3Y452 100 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01559Q495D7 138 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 MUC21Q5SSG8 566 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 WDR73Q6P4I2 378 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 MUC4Q99102 2169 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 F5H768 121 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 S100PP25815 95 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 RASL11AQ6T310 242 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0J9YY99 117 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PPQ1 181 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SH2D1AO60880 128 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SCO1O75880 301 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 IGHV3-53P01767 116 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TYMSP04818 313 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 COX19Q49B96 90 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 KCNS1Q96KK3 526 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 NAGKQ9UJ70 344 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 CBY3A6NI87 242 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 F2Z2F3 143 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 NUDT3O95989 172 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TCL1AP56279 114 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 TCTAP57738 103 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 PRR27Q6MZM9 219 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-216ENST00000428482 CNFNQ9BYD5 112 aa7.14□□□□□ -1.27
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