RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 ODF3Q96PU9 254 aa12.77□□□□□ -0.36
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HCLS1-202ENST00000428394 HERVK_113P61574 105 aa12.77□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.77□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 GPHB5Q86YW7 130 aa12.77□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 C20orf173Q96LM9 149 aa12.77□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 K7EMT4 169 aa12.76□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.76□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 K7ERJ3 54 aa12.74□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 TIMM17AQ99595 171 aa12.74□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.73□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 NDUFS8O00217 210 aa12.72□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 VCYO14598 125 aa12.72□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 RIPPLY3P57055 190 aa12.72□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 SCGB2A2Q13296 93 aa12.72□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HCLS1-202ENST00000428394 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.72□□□□□ -0.37
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HCLS1-202ENST00000428394 A6NDX4 124 aa12.7□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 ZNF815PA8K554 130 aa12.69□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 COL12A1Q99715 3063 aa12.68□□□□□ -0.38
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.68□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.66□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.66□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.65□□□□□ -0.38
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HCLS1-202ENST00000428394 CFHR3Q02985 330 aa12.65□□□□□ -0.38
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZQT7 251 aa12.65□□□□□ -0.38
HCLS1-202ENST00000428394 RNF152Q8N8N0 203 aa12.65□□□□□ -0.38
HCLS1-202ENST00000428394 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.64□□□□□ -0.39
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2D3P61077 147 aa12.64□□□□□ -0.39
HCLS1-202ENST00000428394 UBE2D2P62837 147 aa12.64□□□□□ -0.39
HCLS1-202ENST00000428394 WFDC2Q14508 124 aa12.64□□□□□ -0.39
HCLS1-202ENST00000428394 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.64□□□□□ -0.39
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HCLS1-202ENST00000428394 C9orf85Q96MD7 179 aa12.64□□□□□ -0.39
HCLS1-202ENST00000428394 KLK15Q9H2R5 256 aa12.64□□□□□ -0.39
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