RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC50A1Q9BRV3 221 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NAA60Q9H7X0 242 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TAS2R8Q9NYW2 309 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 COL4A1P02462 1669 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCC3O15438 1527 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL9Q8IWT3 2517 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DOCK10Q96BY6 2186 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SIP14410 1827 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LYRM1O43325 122 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 EDF1O60869 148 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ASAH2BP0C7U1 165 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 IFITM1P13164 125 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CKS2P33552 79 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SSR2P43308 183 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE6HQ13956 83 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q1T7F1 81 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB113Q30KQ7 82 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q56UQ5 140 aa1.18□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 SVBPQ8N300 66 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 VSTM2AQ8TAG5 236 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf105Q8TEF2 133 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 COPS9Q8WXC6 57 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RAB37Q96AX2 223 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00526Q96FQ7 95 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CST11Q9H112 138 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SAR1AQ9NR31 198 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 GAPVD1Q14C86 1478 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SHANK2Q9UPX8 1470 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DIP2BQ9P265 1576 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NINQ8N4C6 2090 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PRS3 328 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf70A6NJV1 201 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 J3QLW9 94 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa1.17□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 APOC2P02655 101 aa1.17□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00269Q8N2A0 174 aa1.17□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 TEX14Q8IWB6 1497 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PSME4Q14997 1843 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RP1P56715 2156 aa1.17□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMB4A4D0S4 1761 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NSD3Q9BZ95 1437 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 BRWD1Q9NSI6 2320 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 EXPH5Q8NEV8 1989 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TOP2BQ02880 1626 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 UQCRHLA0A096LP55 91 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MT-ATP8P03928 68 aa1.16□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NPC2P61916 151 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 UBA52P62987 128 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 INSL4Q14641 139 aa1.16□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 PYY3Q5JQD4 70 aa1.16□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q8TAT8 98 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM254Q8TBM7 123 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q9H521 79 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGI2Q86UL8 1455 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MED12LQ86YW9 2145 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCC5O15440 1437 aa1.15□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ERICH3Q5RHP9 1530 aa1.15□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa1.15□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RBAKDNA6NC62 111 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM262E9PQX1 116 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BQF6 201 aa1.15□□□□□ -2.23
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