RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 J3QLI3 93 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GW64 132 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IFITM1P13164 125 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 WT1-ASQ06250 92 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 A0A096LNI7 61 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.32□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 H0Y9J4 135 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IGHV2-5P01817 119 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 DEFB1P60022 68 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 DLEU1O43261 78 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 IGHG2P01859 326 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 PYY3Q5JQD4 70 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.31□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 J3QQQ9 107 aa8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.3□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 COX7A2LO14548 114 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 C9JQL5 133 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.29□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ETDBQ3ZM63 59 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 EML5Q05BV3 1969 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 K7EQD1 137 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 FXYD5Q96DB9 178 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 PROK2Q9HC23 129 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 KLK12Q9UKR0 248 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 C9orf118A6NHY6 69 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.28□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.27□□□□□ -1.08
CLN8-201ENST00000331222 RBAKDNA6NC62 111 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ADCYAP1P18509 176 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 IGLC2P0DOY2 106 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 IGLC3P0DOY3 106 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ZNF726P1Q15940 193 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 SVIPQ8NHG7 77 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 AJUBAQ96IF1 538 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.27□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ZNF524Q96C55 264 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 C16orf74Q96GX8 76 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 U3KQA8 63 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 IGKV4-1P06312 121 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 M0R2N4 97 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 SORL1Q92673 2214 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ACYP1P07311 99 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZWC4 215 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 V9GYV3 84 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.26□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 F8VRH5 84 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 CTSGP08311 255 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 FNDC10F2Z333 226 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 CTSZQ9UBR2 303 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 A0A0J9YWU9 116 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 C15orf65H3BRN8 121 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 GPHB5Q86YW7 130 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 DEFB125Q8N687 156 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.25□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLN8-201ENST00000331222 IGLL1P15814 213 aa8.24□□□□□ -1.09
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