RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R2Z0 102 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 SNAI2O43623 268 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRG1Q3Y452 100 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 AMTNQ6UX39 209 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZQT7 251 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 STHQ8IWL8 128 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.48□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 GNRH2O43555 120 aa7.47□□□□□ -1.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 CD7P09564 240 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM18Q96B42 140 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGGTB-201ENST00000319942 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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RABGGTB-201ENST00000319942 H3BVH4 76 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PPBPP02775 128 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.46□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 NF1P21359 2839 aa7.45□□□□□ -1.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 CKS2P33552 79 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ESDP10768 282 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD7P58549 80 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 AMN1Q8IY45 258 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ORMDL3Q8N138 153 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01587Q99440 93 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R381 172 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SERF1AO75920 110 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 INSP01308 110 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT8Q8NBV8 401 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PRELID3AQ96N28 172 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KQK5 164 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM17P0DL12 118 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 HTN1P15515 57 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB4AP20338 218 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 EVI2AP22794 236 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 NIT1Q86X76 327 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N1Y9 231 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf56Q8N813 242 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF747Q9BV97 191 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.43□□□□□ -1.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 IFITM10A6NMD0 228 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 D6R8Y8 96 aa7.42□□□□□ -1.22
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RABGGTB-201ENST00000319942 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 XCL2Q9UBD3 114 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00614P0C842 121 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PMCHP20382 165 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCJQ1A5X6 159 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR31Q5SQ13 230 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF185Q96GF1 192 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf85Q96MD7 179 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1S3Q96PC3 154 aa7.41□□□□□ -1.22
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