RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ODF1Q14990 250 aa14.96□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.96□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 AP1S3Q96PC3 154 aa14.96□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 K7EQG2 157 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ATP5LO75964 103 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 FGF6P10767 208 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 RASL10AQ92737 203 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 CENPEQ02224 2701 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 PTPN13Q12923 2485 aa14.95□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 MGPP08493 103 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 RNF152Q8N8N0 203 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 DUX5Q96PT3 197 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 A0A0J9YX75 114 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 NXPH4O95158 308 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 TCTAP57738 103 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ODF3Q96PU9 254 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 FOXC2Q99958 501 aa14.94□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 C7orf71A4D174 169 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 Q6ZVH6 145 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 C20orf78Q9BR46 151 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ZMAT4Q9H898 229 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 COX11Q9Y6N1 276 aa14.93□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.92□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 IGKV3-20P01619 116 aa14.92□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.91□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 CD7P09564 240 aa14.91□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 RBX1P62877 108 aa14.9□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.9□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 IGKCP01834 107 aa14.9□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 NMUP48645 174 aa14.9□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 Q8N2B8 174 aa14.9□□□□□ -0.02
CXCL16-201ENST00000293778 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 DPM2O94777 84 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.89□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 PPP1R17O96001 155 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 EPG5Q9HCE0 2579 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 K7EMI3 77 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 PCP2Q8IVA1 136 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.88□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 SLURP1P55000 103 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 LINC00315P59091 139 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 DEFB136Q30KP8 78 aa14.87□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 CDKN1BP46527 198 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 MUC4Q99102 2169 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 JPT2Q9H910 190 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.86□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 CREBBPQ92793 2442 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TAX1BP3O14907 124 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 SIVA1O15304 175 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TOMM6Q96B49 74 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 A0A087WX48 190 aa14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 C9orf85Q96MD7 179 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 SCGB3A1Q96QR1 104 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 CSTL1Q9H114 145 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 TMEM160Q9NX00 188 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 MDFICQ9P1T7 246 aa14.84□□□□□ -0.03
CXCL16-201ENST00000293778 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 LINC01619G3V211 115 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.83□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 A0A087WWL8 130 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 Q8N1Y9 231 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 SEC11AP67812 179 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 AMTNQ6UX39 209 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 OR11H1Q8NG94 326 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.82□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 HSD52Q0P140 79 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 C2orf66Q6UXQ4 117 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 SYT8Q8NBV8 401 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 F5H697 171 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 PTTG1IPP53801 180 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 UBE2V1Q13404 147 aa14.81□□□□□ -0.04
CXCL16-201ENST00000293778 K7EP13 123 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms