RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 ERVFC1-1P60608 527 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 DNLZQ5SXM8 178 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 Q6AWC8 147 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 Q6ZWC4 215 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 ODF3Q96PU9 254 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 C9JCJ5 164 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TYMSP04818 313 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 PKIAP61925 76 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 RNF151Q2KHN1 245 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 B9D2Q9BPU9 175 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 B4DEV8 164 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TCL1AP56279 114 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TIRAPP58753 221 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 UQCC3Q6UW78 93 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 NAT8Q9UHE5 227 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 CELA1Q9UNI1 258 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 A0A0J9YWU9 116 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 H7BYZ3 331 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TSTD3H0UI37 97 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 H3BVH4 76 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 RRN3P1Q2M238 152 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 Q8NAQ8 132 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 ISOC2Q96AB3 205 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SPINK4O60575 86 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 P01737 135 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SCGB1A1P11684 91 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 PTTG1IPP53801 180 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SFRP2Q96HF1 295 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SPATA25Q9BR10 227 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 CXorf65A6NEN9 183 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 C5orf52A6NGY3 159 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 DEFB130BP0DP73 79 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 DEFB130AP0DP74 79 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SEC61GP60059 68 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 SEC11CQ9BY50 192 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 TMEM189A5PLL7 270 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 GTSF1Q8WW33 167 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 ZMAT4Q9H898 229 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 JPT2Q9H910 190 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPA-201ENST00000260116 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 Q6ZTI0 123 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 M0R381 172 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 AMBPP02760 352 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 V9GYV3 84 aa7.77□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 EREGO14944 169 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 IGHV3-53P01767 116 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 TDRG1Q3Y452 100 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 LINC01559Q495D7 138 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.76□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 GAGE12BA1L429 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 GAGE7O76087 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 GAGE12FP0CL80 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 GAGE12GP0CL81 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 GAGE12IP0CL82 117 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.75□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 HIGD1CA8MV81 97 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 ASIPP42127 132 aa7.74□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
TTPA-201ENST00000260116 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms