RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 DAND5Q8N907 189 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 CACNA1EQ15878 2313 aa12.51□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 K7ENP7 123 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 ZMAT4Q9H898 229 aa12.5□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 FAM236CP0DP71 79 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.5□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-17P01599 117 aa12.5□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 CADP27708 2225 aa12.49□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 Q9UFV3 132 aa12.49□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 E7EQL1 145 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 EML6Q6ZMW3 1958 aa12.48□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 NCOR1O75376 2440 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 LY6HO94772 140 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 GATA3P23771 443 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 C20orf197Q8N268 126 aa12.48□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 COX7B2Q8TF08 81 aa12.47□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.47□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.47□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 A0A0U1RQV1 116 aa12.47□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.47□□□□□ -0.41
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CTIF-201ENST00000256413 IGLV1-44P01699 117 aa12.46□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 SVIPQ8NHG7 77 aa12.46□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 XGP55808 180 aa12.46□□□□□ -0.41
CTIF-201ENST00000256413 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.46□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MBD6Q96DN6 1003 aa12.46□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 VWA8A3KMH1 1905 aa12.46□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa12.45□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 M0QXV9 152 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-69P01742 117 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MP68P56378 58 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 Q96MF0 132 aa12.43□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.43□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 PLXNA2O75051 1894 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 NREPQ16612 68 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 Q9HAA7 133 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 P0C879 139 aa12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 RNF152Q8N8N0 203 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa12.42□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 H3BQ85 93 aa12.42□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 PRAC2D3DTV9 90 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 XCL1P47992 114 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 IMUPQ9GZP8 106 aa12.41□□□□□ -0.42
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CTIF-201ENST00000256413 C5orf38Q86SI9 138 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 UPK3BQ9BT76 320 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 KAAG1Q9UBP8 84 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 COX7A2LO14548 114 aa12.41□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 P0DMU3 169 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 FAM231AP0DMU4 169 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 FAM231CP0DMU5 169 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 PRSS33Q8NF86 280 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
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