RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 E7EQL1 145 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 GAGE7O76087 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 GAGE12FP0CL80 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 GAGE12GP0CL81 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 GAGE12IP0CL82 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 GAGE4Q13068 117 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 TIMD4Q96H15 378 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 CRLF1O75462 422 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 UBE2D3P61077 147 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 UBE2D2P62837 147 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0G2JNJ9 132 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 DEFB124Q8NES8 71 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 Q9UFV3 132 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 A0A0J9YY99 117 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 A4D1N5 150 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 PRSS2P07478 247 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 CD7P09564 240 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 IFITM1P13164 125 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 RNF5Q99942 180 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.02□□□□□ -0.8
ITGA3-201ENST00000007722 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ASIPP42127 132 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 PRR9Q5T870 116 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 METTL26Q96S19 204 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 BUB3O43684 328 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 NPC2P61916 151 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 A0A087WWL8 130 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 LINC01619G3V211 115 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 GNRH2O43555 120 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 LINC00527Q9UJ94 153 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 IGFL2Q6UWQ7 119 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 Q6ZS92 163 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 Q8N1Y9 231 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 G3V318 75 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 J3QQQ9 107 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.99□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3-30P01768 117 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 PMVKQ15126 192 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP161Q6P656 301 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 LINC01560Q8TB33 94 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 F6UB75 175 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 CD3EP07766 207 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 JPT2Q9H910 190 aa9.98□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 LY6LH3BQJ8 138 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 RHODO00212 210 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ATMQ13315 3056 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 COX6B1P14854 86 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF56Q15929 161 aa9.97□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 RBAKDNA6NC62 111 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 C2orf82Q6UX34 121 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-201ENST00000007722 CRYGDP07320 174 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SRD5A1P18405 259 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ATXN8Q156A1 80 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 NPBQ8NG41 125 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 CITED1Q99966 193 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.96□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ATP6V0E1O15342 81 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 LINC01620Q4KN68 170 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 H3BMM0 161 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 UBE2WQ96B02 151 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-201ENST00000007722 ELANEP08246 267 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms