RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 SFTA2Q6UW10 78 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 SIGMAR1Q99720 223 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1EQ15878 2313 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 NPC2P61916 151 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-228ENST00000636120 BRWD1Q9NSI6 2320 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 PSCAO43653 123 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 HLA-DMBP28068 263 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 GATD1Q8NB37 220 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0U1RRA0 63 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01545Q5VT33 79 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf82Q6UX34 121 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 RIPPLY3P57055 190 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf118A6NHY6 69 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CEND1Q8N111 149 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CFHR3Q02985 330 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 GNRH2O43555 120 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 MYCNOSP40205 109 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SLURP1P55000 103 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF747Q9BV97 191 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 U3KQE9 123 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 MORN5Q5VZ52 161 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WW49 117 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf70A6NJV1 201 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGLL1P15814 213 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CTRLP40313 264 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 PKIGQ9Y2B9 76 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 K7EQD1 137 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G5P39877 138 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 BLCAPP62952 87 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 F6UB75 175 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE6Q13070 117 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SUMO4Q6EEV6 95 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 F8WEM9 126 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 HERV-K104P63124 156 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ODF3Q96PU9 254 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZMAT4Q9H898 229 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 PRB1P04280 392 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 J3QQQ9 107 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 EREGO14944 169 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 WISP2O76076 250 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CRYGBP07316 175 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LMO4P61968 165 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DYSFO75923 2080 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1DQ01668 2161 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 E7EUB6 86 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 F8W1H4 67 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LY6LH3BQJ8 138 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 IGF1P05019 195 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 EBI3Q14213 229 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZPA2 131 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LGALS9O00182 355 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB136Q30KP8 78 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 INSL3P51460 131 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF124Q15973 351 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 K7EP34 96 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE2EQ4V326 116 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-228ENST00000636120 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.98□□□□□ -1.61
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