RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636060.1

LIN28B-AS1-202, LIN28B antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene LIN28B-AS1, Length 548 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MDFICQ9P1T7 246 aa7.23□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LY6G6CO95867 125 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GCGP01275 180 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PPT1P50897 306 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF415Q09FC8 603 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SMUG1Q53HV7 270 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NAGKQ9UJ70 344 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.22□□□□□ -1.25
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MUC4Q99102 2169 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GNRH2O43555 120 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TYMSP04818 313 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FMC1Q96HJ9 113 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C18orf15Q96N68 181 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.21□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NACAE9PAV3 2078 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 F5H768 121 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LTAP01374 205 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 HOXA5P20719 270 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 AKR1C3P42330 323 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 CRIP1P50238 77 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 UBE2G1P62253 170 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KCNS1Q96KK3 526 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MANBALQ9NQG1 85 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 GNG13Q9P2W3 67 aa7.2□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.19□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C11orf52Q96A22 123 aa7.19□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SPXQ9BT56 116 aa7.19□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.19□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.19□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.18□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.18□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TEX46H3BTG2 121 aa7.18□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.18□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SH2D1AO60880 128 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF575Q86XF7 245 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RASL10AQ92737 203 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 C9orf85Q96MD7 179 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DERL1Q9BUN8 251 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MLST8Q9BVC4 326 aa7.17□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 A0A0J9YY99 117 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 M0R2P5 195 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IFNA1P01562 189 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGHV3-53P01767 116 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 P0DMU3 169 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM231AP0DMU4 169 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM231CP0DMU5 169 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BCL2P10415 239 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BLOC1S1P78537 153 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 OR5I1Q13606 314 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KMT2AQ03164 3969 aa7.16□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 B4DEV8 164 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 H3BNG1 76 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 NUDT3O95989 172 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 SFTA3P0C7M3 94 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FHL2Q14192 279 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 LINC01559Q495D7 138 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 DNLZQ5SXM8 178 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 BAGE2Q86Y30 109 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ZNF479Q96JC4 524 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 VAX2Q9UIW0 290 aa7.15□□□□□ -1.26
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 M0R036 132 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 IGLV2-8P01709 118 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ORM1P02763 201 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 RNF212Q495C1 297 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 PTH2Q96A98 100 aa7.14□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.13□□□□□ -1.27
LIN28B-AS1-202ENST00000636060 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms