RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 M0R2P5 195 aa14.99□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 EREGO14944 169 aa14.99□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 ORM1P02763 201 aa14.99□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 TYMSP04818 313 aa14.99□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 STAG3L2P0CL84 134 aa14.99□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 STAG3L3P0CL85 134 aa14.99□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 F6UZH7 168 aa14.98□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 ERVFC1-1P60608 527 aa14.97□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.96□□□□□ -0.01
SRRT-218ENST00000620394 KCNS1Q96KK3 526 aa14.96□□□□□ -0.01
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SRRT-218ENST00000620394 ATP6V0CP27449 155 aa14.95□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 NFE4Q86UQ8 179 aa14.95□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.95□□□□□ -0.02
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SRRT-218ENST00000620394 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.95□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.95□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.94□□□□□ -0.02
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SRRT-218ENST00000620394 SERF2P84101 59 aa14.94□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.94□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 ASB13Q8WXK3 278 aa14.94□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.94□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 MBP02144 154 aa14.93□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 GGTLC3B5MD39 225 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 IGLV2-11P01706 119 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 TIRAPP58753 221 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 MED28Q9H204 178 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.92□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 MYCBP2O75592 4640 aa14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 K7EQM0 130 aa14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 SGK494Q96LW2 274 aa14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.91□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 EVI2AP22794 236 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 C9orf85Q96MD7 179 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 PSG8Q9UQ74 426 aa14.9□□□□□ -0.02
SRRT-218ENST00000620394 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 CXorf1O96002 111 aa14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 Q5BKY6 102 aa14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 FAT1Q14517 4588 aa14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 A0A087WTM6 91 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 RNF222A6NCQ9 220 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 TAAR5O14804 337 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 CIDEAO60543 219 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 GCGP01275 180 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 PTH2Q96A98 100 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 EPDR1Q9UM22 224 aa14.88□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 RS1O15537 224 aa14.87□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 ZNF876PQ49A33 203 aa14.87□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.87□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.87□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 A0A1W2PRE2 83 aa14.86□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 KRTAP10-1P60331 282 aa14.86□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 ZFP69Q49AA0 526 aa14.86□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 SMUG1Q53HV7 270 aa14.86□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.86□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 CRYGDP07320 174 aa14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 RHOHQ15669 191 aa14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.85□□□□□ -0.03
SRRT-218ENST00000620394 ZNF726P1Q15940 193 aa14.84□□□□□ -0.03
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