RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	OTOR	Q9NRC9	128 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ILF3-223	ENST00000593061	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TNP2	Q05952	138 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061		A0A096LPF7	62 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF575	Q86XF7	245 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	PAX4	O43316	350 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061		Q6AWC8	147 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1W2PRE2	83 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	GNG5	P63218	68 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061		F6UZH7	168 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	C8orf49	Q96NF6	230 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ILF3-223	ENST00000593061	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1B0GV50	99 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	PPT1	P50897	306 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	UBE2G2	P60604	165 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	PRO0255	Q9UI72	69 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	FAM74A7	A6NL05	159 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SFTA3	P0C7M3	94 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	CRYBA4	P53673	196 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	FHL2	Q14192	279 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SGK494	Q96LW2	274 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TREM1	Q9NP99	234 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SLA	Q13239	276 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TVP23C	Q96ET8	276 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SPX	Q9BT56	116 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	RYR1	P21817	5038 aa		13.25	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	GNRH2	O43555	120 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF479	Q96JC4	524 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	PAGE4	O60829	102 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	CCL20	P78556	96 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TDRG1	Q3Y452	100 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	CST9LP1	Q5W188	147 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	C16orf90	A8MZG2	172 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SIVA1	O15304	175 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	NXPH4	O95158	308 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	IFNA7	P01567	189 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TCRA	P04437	139 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	RASL10A	Q92737	203 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	HSPG2	P98160	4391 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061		K7EQM0	130 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TYMS	P04818	313 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ILF3-223	ENST00000593061		M0R2P5	195 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	IFNA1	P01562	189 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	KCNS1	Q96KK3	526 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061		K7EQD1	137 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	GYPE	P15421	78 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	SRI	P30626	198 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00315	P59091	139 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ILF3-223	ENST00000593061	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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