RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF124	Q15973	351 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRR9	Q5T870	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	TWIST1	Q15672	202 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		A0A087WW49	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		F6UB75	175 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	AMN1	Q8IY45	258 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q8N2B8	174 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494		J3KRW8	73 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	DLEU1	O43261	78 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	GAGE1	Q13065	139 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.02	□□□□□ -0.8
ZNRF1-208	ENST00000568494	CSN3	P07498	182 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LINC00614	P0C842	121 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494		U3KQK5	164 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494		D6R8Y8	96 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LEPROTL1	O95214	131 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TSPO	P30536	169 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	DCANP1	Q8TF63	244 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR5AL1	P0C617	328 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGLL1	P15814	213 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	ID1	P41134	155 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM160	Q9NX00	188 aa		10	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LGALS9	O00182	355 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TFPI2	P48307	235 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR4C46	A6NHA9	309 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SMKR1	H3BMG3	65 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMEM86B	Q8N661	226 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	STPG4	Q8N801	248 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	RNF185	Q96GF1	192 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRELID3A	Q96N28	172 aa		9.99	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	KIR3DS1	Q14943	382 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	ORMDL3	Q8N138	153 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TEX29	Q8N6K0	151 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	DEFB136	Q30KP8	78 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	ST20	Q9HBF5	79 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	NPS	P0C0P6	89 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	CKS2	P33552	79 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLURP1	P55000	103 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	NCR2	O95944	276 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	PET117	Q6UWS5	81 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q6ZSV7	163 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	FA2H	Q7L5A8	372 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		9.96	□□□□□ -0.81
ZNRF1-208	ENST00000568494	SNAI2	O43623	268 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNRF1-208	ENST00000568494	NPY	P01303	97 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF688	P0C7X2	276 aa		9.95	□□□□□ -0.82
ZNRF1-208	ENST00000568494	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
ZNRF1-208	ENST00000568494	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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