RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 PEX7O00628 323 aa13.85□□□□□ -0.19
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CMTM3-211ENST00000565922 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.81□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.81□□□□□ -0.2
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CMTM3-211ENST00000565922 Q86TA4 180 aa13.8□□□□□ -0.2
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CMTM3-211ENST00000565922 LINC00479Q96M42 142 aa13.8□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.8□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 DNAH10Q8IVF4 4471 aa13.8□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.79□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 Q6ZNX1 250 aa13.79□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.79□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 FRAS1Q86XX4 4008 aa13.79□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 A0A096LPF7 62 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 CRYBA4P53673 196 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 FHL2Q14192 279 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 UPK3BQ9BT76 320 aa13.78□□□□□ -0.2
CMTM3-211ENST00000565922 AKR1C3P42330 323 aa13.77□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 TEX46H3BTG2 121 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 CIDEAO60543 219 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 PAGE4O60829 102 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 C1QBP02746 253 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 ESRGQ1W209 222 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF479Q96JC4 524 aa13.76□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.76□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 SFTA3P0C7M3 94 aa13.75□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF876PQ49A33 203 aa13.75□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 TTC32Q5I0X7 151 aa13.75□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.75□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1B0GV50 99 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 C9JCJ5 164 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 RTL8CO15255 209 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 PTH2Q96A98 100 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 C9orf85Q96MD7 179 aa13.74□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.73□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 MANBALQ9NQG1 85 aa13.73□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 SRIP30626 198 aa13.72□□□□□ -0.21
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CMTM3-211ENST00000565922 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.72□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1W2PPQ1 181 aa13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 B4DEV8 164 aa13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.71□□□□□ -0.21
CMTM3-211ENST00000565922 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.7□□□□□ -0.22
CMTM3-211ENST00000565922 K7EQD1 137 aa13.7□□□□□ -0.22
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