RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.18□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 K7EP13 123 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 ATP5J2P56134 94 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 FOXC2Q99958 501 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SPRY2O43597 315 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 LAGE3Q14657 143 aa13.17□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 F6UB75 175 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 IGLV1-40P01703 118 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 MSMBP08118 114 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.16□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 IGKCP01834 107 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 HSD52Q0P140 79 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 ATP5LO75964 103 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 KIR3DS1Q14943 382 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 TM4SF20Q53R12 229 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 MRAP2Q96G30 205 aa13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
MEIS3-211ENST00000561204 M0R381 172 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 AVPP01185 164 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SMPXQ9UHP9 88 aa13.14□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 DPM2O94777 84 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 CFHR3Q02985 330 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 A6NDN8 102 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 PSMG4Q5JS54 123 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.13□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SPG11Q96JI7 2443 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 A0A0G2JLM5 398 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 EDN2P20800 178 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 ASIPP42127 132 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 H3BRM9 83 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 GTSCR1Q86UQ5 136 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RASL10AQ92737 203 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 GNRH2O43555 120 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 FLNCQ14315 2725 aa13.11□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SRD5A1P18405 259 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RBX1P62877 108 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM95Q3KNT9 176 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM160Q9NX00 188 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 C9orf118A6NHY6 69 aa13.1□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 A0A087WX48 190 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 MED14OSP0DP75 135 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 JMJD8Q96S16 334 aa13.09□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.08□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 B4DSR2 109 aa13.08□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 HIGD1BQ9P298 99 aa13.08□□□□□ -0.31
MEIS3-211ENST00000561204 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 RNF223E7ERA6 249 aa13.08□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 NRGNQ92686 78 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 C20orf78Q9BR46 151 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 H3BUT2 72 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 K7EMT4 169 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 PIEZO1Q92508 2521 aa13.07□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 KLLNB2CW77 178 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 DCANP1Q8TF63 244 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.06□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 MGPP08493 103 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 HLA-DRB4P13762 266 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 PSMB8P28062 276 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 CST9LQ9H4G1 147 aa13.05□□□□□ -0.32
MEIS3-211ENST00000561204 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.05□□□□□ -0.32
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