RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.67□□□□□ -1.02
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USP3-AS1-205ENST00000560067 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.67□□□□□ -1.02
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USP3-AS1-205ENST00000560067 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C9orf85Q96MD7 179 aa8.58□□□□□ -1.04
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USP3-AS1-205ENST00000560067 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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USP3-AS1-205ENST00000560067 PTH2Q96A98 100 aa8.57□□□□□ -1.04
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USP3-AS1-205ENST00000560067 GYPEP15421 78 aa8.56□□□□□ -1.04
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